Additional file 19 of In silico evaluation and selection of the best 16S rRNA gene primers for use in next-generation sequencing to detect oral bacteria and archaea

  1. Regueira-Iglesias, Alba 1
  2. Vázquez-González, Lara 1
  3. Balsa-Castro, Carlos 1
  4. Vila-Blanco, Nicolás 1
  5. Blanco-Pintos, Triana 1
  6. Tamames, Javier 2
  7. Carreira, Maria José 1
  8. Tomás, Inmaculada 1
  1. 1 Universidade de Santiago de Compostela
    info

    Universidade de Santiago de Compostela

    Santiago de Compostela, España

    ROR https://ror.org/030eybx10

  2. 2 National Center for Biotechnology
    info

    National Center for Biotechnology

    Astaná, Kazajstán

    ROR https://ror.org/00xhcc696

Verleger: figshare

Datum der Publikation: 2024

Art: Dataset

CC BY 4.0

Zusammenfassung

Additional file 19: List of the primer pairs utilised in the reviewed oral microbiome studies through 16S rRNA gene sequencing.

Bibliographische Referenzen

  • 10.1016/j.jmb.2019.05.016
  • 10.1038/s41368-022-00163-7
  • 10.1016/j.micinf.2015.03.014
  • 10.1111/odi.12509
  • 10.1002/cpmb.59
  • 10.3390/microorganisms8020308
  • 10.1007/s00203-018-1505-3
  • 10.1016/j.phrs.2012.11.006
  • 10.1099/mgen.0.000409
  • 10.1016/j.annepidem.2016.04.005
  • 10.1101/gr.085464.108
  • 10.1016/j.scitotenv.2017.09.228
  • 10.1111/1758-2229.12684
  • 10.3748/wjg.v16.i33.4135
  • 10.4014/jmb.1403.03032
  • 10.1111/1755-0998.13215
  • 10.1093/nar/gks1219
  • 10.1093/nar/gkt1244
  • 10.1038/ismej.2011.208
  • 10.18637/jss.v025.i05
  • 10.1093/bioinformatics/btn322
  • 10.1093/nar/gkv784
  • 10.1093/nar/gkv1290
  • 10.1093/nar/gkv1189
  • 10.1093/nar/gkv1276
  • 10.1038/nmeth.3869
  • 10.1093/bioinformatics/btp163
  • 10.1038/s41587-020-0501-8
  • 10.1016/j.mimet.2003.08.009
  • 10.1128/aem.03006-05
  • 10.1111/j.1600-051x.1998.tb02419.x
  • 10.1016/j.ijmm.2015.08.018
  • 10.1177/0022034515594779
  • 10.4103/jpbs.jpbs_288_16
  • 10.1099/00207713-46-3-745
  • 10.1099/ijs.0.000950-0
  • 10.1177/0022034519831671
  • 10.1111/j.1399-302x.2008.00470.x
  • 10.1159/000222659
  • 10.1128/jcm.02427-10
  • 10.5114/ceji.2015.51358
  • 10.1016/j.anaerobe.2012.04.006
  • 10.1016/j.joen.2017.03.019
  • 10.1111/omi.12118
  • 10.1111/jcpe.12463
  • 10.1101/gr.3.3.s30