Análisis de parentescos mediante el uso de marcadores moleculares

Resumen

La inferencia de las relaciones de parentesco entre individuos apartir de su parecido molecular representa una metodología de granutilidad para la mejora genética en Acuicultura. Ésta posibilita la reorganización de los stocks de reproductores en grupos de mínimoparentesco, así como la identificación de las familias en planes deselección, para evitar las consecuencias nocivas de la consanguinidady mantener la máxima diversidad a través de las generaciones. Laelección del marcador y de la metodología estadística apropiados, esfundamental para lograr la mejor solución a la problemática planteada.Dependiendo de si tenemos información previa de los grupos generacionales o no, respectivamente, aplicaremos el análisis de paternidado de parentesco. La aproximación más sencilla para el análisis depaternidad, implica la identificación de los progenitores a partir de laexclusión del resto de candidatos. Sin embargo, esto puede conducir a más de una solución, resoluble probabilísticamente aplicando métodosde máxima verosimilitud. La capacidad para identificar los progenito-res depende del escenario muestral (número de progenitores posibley proporción muestreada), de las características de los marcadoresaplicados (polimorfismo, errores de genotipado), así como del gradode cumplimiento de las asunciones teóricas de los modelos aplicados.Existen una gran variedad de programas disponibles relacionados conel análisis de paternidad, que suelen presentar prestaciones comple-mentarias.Cuando se tiene un grupo de individuos de una sola generación ode relación generacional incierta, el objetivo es estimar las relacionesgenéticas entre los individuos, habitualmente expresadas en función delcoeficiente de parentesco. El problema general es determinar qué parte del parecido a nivel molecular (identidad en estado) se debe a identidadpor descendencia (el parámetro de interés). Existen dos grandes gruposde estimadores a partir de la información molecular. En el primero seestiman las relaciones por separado para cada pareja de individuos (métodos pairwise), usualmente utilizando las frecuencias génicas de lapoblación de referencia. Dentro de estos se pueden encontrar los deno-minados Métodos de Momentos (MME) y los basados en Máxima Vero-similitud (MLE). El otro grupo de estimadores utiliza la informaciónde todos los individuos conjuntamente para determinar la estructurafamiliar más probable. Por su naturaleza estos métodos realizan unareconstrucción explícita de la genealogía (al menos en una generación),que ha dado lugar a la población actual. Dependiendo del tipo de estimador y de las asunciones que se hacen en su elaboración, cada uno deellos tiene ventajas y limitaciones que hay que tener en cuenta cuandose decide el estimador a usar. En el presente trabajo se analizan losestimadores más importantes y se ofrece una relación de herramientasinformáticas de uso libre que los implementan.