Herramientas bioinformáticas para el análisis genómico

  1. J.A. Álvarez Dios 1
  2. A. Gómez Tato 2
  1. 1 Universidade de Santiago de Compostela. Departamento de Matemática Aplicada
  2. 2 Universidade de Santiago de Compostela. Departamento de Matemáticas
Libro:
Genética y genómica en acuicultura
  1. Paulino Martínez Portela (coord.)
  2. Antonio Figueras Huerta (coord.)

Editorial: Fundación Observatorio Español de Acuicultura

Ano de publicación: 2009

Páxinas: 849-889

Tipo: Capítulo de libro

Resumo

La Bioinformática se ha convertido en una disciplina científica esencial en el campo genómico como consecuencia directa del aumento exponencial en la cantidad de datos disponibles. Existen muchas y buenas herramientas bioinformáticas que facilitan el trabajo diario en el laboratorio y permiten aumentar la productividad y la calidad de los datos. En este capítulo pasamos revista a algunas de ellas. Comenzamos con la descripción de las herramientas más usadas en un proyecto de secuenciación. Continuamos haciendo una pequeña revisión de bases de datos genómicos y de BLAST, lautilidad de búsqueda por autonomasia. Terminamos la primera partecon una visión rápida de los lenguajes de programación más usadosen Bioinformática. La segunda parte la dedicamos al análisis de datosdescribiendo dos de las técnicas más fértiles: construcción de árboles filogenéticos y análisis estadístico de microarrays. En general los programas informáticos citados son de dominio público y muchos decódigo abierto.