El minisatélite msh43una sorprendente secuencia del genoma humano

  1. BARROS FERNANDEZ, PAULA
Dirixida por:
  1. Jaime Gómez Márquez Director
  2. Francisco Boan Fernandez Co-director

Universidade de defensa: Universidade de Santiago de Compostela

Fecha de defensa: 27 de xuño de 2008

Tribunal:
  1. Alicia E. Toranzo Presidenta
  2. Ángel Carracedo Álvarez Secretario
  3. Ramón Soto-Otero Vogal
  4. José Luis Fernández Vogal
  5. Amelia Nieto Martín Vogal
Departamento:
  1. Departamento de Bioquímica e Bioloxía Molecular

Tipo: Tese

Resumo

El minisatélite MsH43 es una secuencia del genoma humano cuyo estudio ha sido el principal objetivo de esta Tesis Doctoral. El análisis del polimorfismo de este locus nos permitió identificar ocho alelos. Las amplificaciones del locus MsH43 de individuos heterocigotos generan estructuras heterodúplex que les confiere un patrón electroforético específico que empleamos para identificar nuevos genotipos. La mayoría de los alelos aislados presentan la capacidad de formar estructuras G-cuadrúplex. Estas estructuras, estabilizadas por potasio, pueden interferir en la síntesis de DNA durante la PCR. Además, hemos analizado si la presencia de los G-cuadrúplex influye en la capacidad recombinogénica de MsH43, empleando para ello un sistema de recombinación homóloga in vitro diseñado en nuestro laboratorio. Los resultados de este análisis no detectaron diferencias en la capacidad recombinogénica entre un alelo que forma G-cuadrúplex y otro que no lo hace. Sin embargo, estos ensayos mostraron que el aumento de la fuerza iónica produce una mayor fidelidad en los eventos recombinatorios, ya que se incrementa la proporción de moléculas recombinantes que mantienen la secuencia original. Por otro lado, el análisis de la historia evolutiva de MsH43 reveló que esta secuencia se originó principalmente por procesos de slippage, mediante los cuales se fue expandiendo hasta alcanzar una organización de secuencia repetitiva en tándem. Según nuestra hipótesis, esta organización surgió durante la génesis de los Monos del Viejo Mundo. El análisis comparativo de las secuencias de MsH43 procedentes de distintas especies de primates, mostró que orangután y humano presentan el mayor grado de homología, lo que contrasta con la filogenia estándar. Para explicar esta paradoja sugerimos la existencia de un alelo ancestral, que denominamos alelo errante, que se ha mantenido prácticamente inalterado en el período evolutivo comprendido entre orangután y humano.