Síntesis de péptidos para el reconocimiento de secuencias específicas del ADN

Abstract

El proceso de la transcripción genética es fundamental en el control del desarrollo y funcionamiento celular. Se ha demostrado la relación entre desajustes del control transcripcional con enfermedades como el cancer; es por lo tanto de gran importancia la comprensión de las bases moleculares de dicho control. La transcripción genética está regulada por proteinas que se unen al ADN de forma especifica llamadas factores de transcripción. El objetivo del presente trabajo de tesis es el diseño y sintesis de análogos peptídicos del factor de transcripción de levaduras GCN4. Dicho factor de transcripción interacciona con el surco mayor del ADN en forma de dímero. El diseño de las moléculas sintetizadas simplifica el motivo de union al ADN tomando unicamente uno de los monómeros, mimetizando el otro por medio de una molécula pequeña capaz de unirse al surco menor del ADN. Se llevó a cabo la síntesis y evaluación de la capacidad de unión de diversas moléculas formadas por la unión covalente de la región de reconocimiento del GCN4 con análogos de la Distamicina, cuya unión al surco menor del ADN ha sido ampliamente documentada. Las pruebas llevadas a cabo mediante tecnicas de Dicroísmo circular y Desplazamiento en Gel de Poliacrilamida demostraron la capacidad de unión al ADN de uno de los análogos sintetizados, con una constante de afinidad en el rango de concentraciones nano Molar. Dichos experimentos tambien demostraron la importancia de la cadena que conecta la región básica del GCN4 con el tripirrol análogo de la Distamicina para permitir la unión al ADN de forma especifica.