Homología entre el DNA humano y el fragmento SmalA del genoma del virus herpes simplex tipo 1nuevos minisatélites en el genoma humano

Zusammenfassung

En el presente trabajo hemos analizado regiones del DNA humano homologas al fragmento SmalA de la región irs/trs del genoma del virus hsv-1. A partir de una genoteca de hígado fetal humano se aislaron tres clones recombinantes, localizándose las regiones implicadas en la homología con SmalA en tres fragmentos de restricción que se denominaron humano2, human42 y human10. El análisis de la secuencia de nucleótidos mostro que estas regiones contenían secuencias cortas ricas en g/c cuya estructura permite incluirlas dentro del grupo de los minisatélites. La homología entre el fragmento viral y los DNAs humanos se debe principalmente a repeticiones del oligomero (ggc) tggg (g). Con el fin de detectar el polimorfismos asociado a las secuencias human10, human42 y humano2, se realizó un estudio preliminar por "southern blot" utilizando DNAs procedentes de linfocitos periféricos de donantes sanos. Comprobamos que human10 y humano2 detectaban loci altamente polimórficos mientras que human42 detecto un locus aparentemente dialelicolocalizado en el cromosoma 1. El análisis por "northern blot" de rnas procedentes de distintos tejidos de rata mostro que la sonda correspondiente a human10 detectaba un transcrito de aproximadamente 4700 bases en testículo.